Nous collaborons avec des instituts de recherche de premier plan, des universités, des leaders d’opinion clés et des experts du secteur, et participons à des discussions scientifiques et réglementaires afin de repousser les limites de la science du microbiome et des découvertes translationnelles. Nous occupons des postes clés au sein d’associations renommées, notamment l’European Microbiome Innovation for Health (EMIH, anciennement Alliance Promotion Microbiome-APM), le Human Microbiome Action Project (HMA),les Ferments du Futur, l’initiative Harmi et le projet French Gut.
Le prélèvement d’échantillons de microbiotes est désormais systématiquement inclus dans chaque étude clinique afin de mieux comprendre les interactions entre l’hôte et les microbes. Notre équipe de recherche interne a développé et standardisé un pipeline d’analyse du microbiome. Ce pipeline couvre l’acquisition et le traitement de différents types d’échantillons, représentant plusieurs microbiotes humains : fécaux (y compris le méconium), vaginaux, buccaux, cutanés et du lait maternel (y compris le colostrum). La collecte de métadonnées sur les échantillons, ainsi que les données de séquençage et l’analyse bio-informatique, fournissent des détails qualitatifs sur l’écologie du microbiote à différents endroits du corps humain et des informations clés sur les interactions métaboliques microbiennes grâce à l’intégration d’approches multi-omiques.
Explorer de nouvelles frontières dans la science du microbiome
Les progrès de la science du microbiome soulèvent également une question importante: « Pouvons-nous aller encore plus loin dans cette exploration à l'intérieur de nous-mêmes ? » Cela s'applique à l'intestin grêle, un territoire inexploré qui abrite des bactéries spécifiques et constitue un environnement dynamique différent du côlon, susceptible de jouer un rôle important au-delà de la digestion. Ces questions intrigantes — Comment les différents microbes de l'intestin grêle modulent-ils la fonction gastro-intestinale et comment les probiotiques peuvent-ils jouer un rôle dans cette niche ? — nous ont amenés à développer une collaboration passionnante avec Nimble Science. Nous avons utilisé une méthode d'échantillonnage innovante appelée « aspiration du microbiome de l'intestin grêle » ( SIMBA™) pour obtenir des échantillons pratiques, non invasifs, de haute qualité et fiables afin d'étudier les interactions entre l'alimentation et le microbiote dans l'intestin grêle. Avec Nimble Science, nous avons publié une étude clinique de validation de principe confirmant l'efficacité de la capsule pour détecter les interventions de souches probiotiques dans l'intestin grêle, ce qui n'était pas possible avec les échantillons de selles conventionnels. Cette capsule de haute précision est désormais reconnue comme un dispositif médical de classe II au Canada et deviendra sans aucun doute un outil de recherche inestimable dans les essais cliniques visant à étudier les interactions entre les probiotiques et le microbiote dans la santé et la maladie, et peut-être à terme pour le diagnostic clinique des affections du tractus gastro-intestinal touchant l'intestin grêle, telles que la prolifération bactérienne dans l'intestin grêle (SIBO).
Développement de probiotiques de nouvelle génération
Notre programme innovant sur le microbiome se concentre également sur le développement de probiotiques de nouvelle génération et l'amélioration de nos capacités industrielles dans ce domaine. Soutenue par une plateforme de recherche intégrée et translationnelle allant des modèles de recherche aux études cliniques et au développement de bioprocédés, notre équipe de recherche interne se spécialise désormais dans plus de 15 espèces de nouvelle génération, dont certaines candidates ont été intégrées dans le pipeline de découverte. Notre engagement s'étend à la résolution de goulots d'étranglement bien connus, en particulier avec les souches anaérobes strictes sensibles à l'exposition à l'oxygène et ayant des besoins nutritionnels spécifiques.
Forts de l'héritage de nos fondateurs, nous continuons à développer le potentiel des probiotiques pour diverses applications dans le domaine de la santé. En développant et en utilisant de nouvelles approches combinant de nouvelles souches candidates et de nouveaux outils, nous avons bon espoir de découvrir des mécanismes sous-jacents"